Początki muzealnictwa geologicznego na Uniwersytecie Wrocławskim sięgają roku 1812. Powstał wtedy Gabinet Mineralogiczny z kolekcjami minerałów, skał i skamieniałości. W 1868 r. Gabinet przekształcony został w Muzeum Mineralogiczne Uniwersytetu Wrocławskiego, a pod koniec XIX w. jego zbiory rozdzielono na dwa tematyczne muzea: mineralogiczne i geologiczno-paleontologiczne. Ich zasoby, znacznie zubożone w wyniku działań II wojny światowej, trafiły w 1945 r. pod opiekę Instytutu Nauk Geologicznych UWr, który w latach 60. i 70. XX w. udostępnił je badaczom i szerokiej publiczności. Muzeum Geologiczne zostało oficjalnie reaktywowane w 1981 r.; swoją działalność prowadzi zgodnie z przepisami statutu Uniwersytetu Wrocławskiego.